На кафедре методики преподавания физики работают две научно-исследовательские лаборатории - содержания и методов обучения физики (СиМОФ) и психодидактики высшего и среднего образования. Именно в рамках этих двух направлений организуется основная учебно-методическая работа, разрабатываются учебные пособия для студентов, строятся новые учебные планы
   Научно-исследовательская лаборатория "Содержания и методов обучения физике" (ауд. 234) оборудована несколькими местами для индивидуальной работы преподавателей кафедры и сотрудников лаборатории. Сотрудниками кафедры разрабатывается учебно-методический комплекс, который включает в себя учебные пособия и видеоматериалы, сборники многовариантных контрольных работ. Пособия предназначены для студентов физических факультетов педагогических вузов, изучающих дисциплины методического цикла. Могут быть рекомендованы для учащихся старших классов средних учебных заведений и учителей физики.
   Научно-исследовательская лаборатория "Психодидактика высшего и среднего образования" (ауд. 202) при взаимодействии со школой, а также в рамках дипломных проектов студентов разрабатывает психодидактические технологии. Работа лаборатории связана с разработкой учебных пособий. В учебных пособиях отражены теоретические основы методологических подходов, указываются пути и пример их реализации. Уже изданы пособия по проблемному, программированному, дискретному, системно-функциональному, системно-структурному, индивидуально-дифференцированному, игровому подходам психодидактики. Психодидактический пакет содержит дидактический материал по конкретной теме физики в соответствии с каждым из 14 методологических подходов. Работа лаборатории направлена на создание учебно-методического комплекса, который позволит облегчить и разнообразить творческий труд рядового учителя школы. Неоднократно, оргкомитет, в который входили сотрудники лаборатории, подготавливал и организовывал всероссийские научно-практические конференции по психодидактике высшего и среднего образования.
   Лаборатория оснащена шкафами для хранения литературы по педагогике, методике преподавания физики. Здесь же хранятся наработанные и систематизированные материалы, которые затем преобразуются в психодидактические пакеты и учебные пособия. Помещение лаборатории оборудовано рабочими местами для проведения лабораторных занятий со студентами. Также студенты имеют возможность работать с литературой и дидактическим материалом в специально отведённое время.
   На кафедре (ауд. 220) собрана большая библиотека методической и психолого-педагогической литературы (несколько тысяч экземпляров книг, 3 комплекта подшивок журналов "Физика в школе" начиная с 1959 года; более четырехсот дипломных работ). Вся эта литература постоянно используется студентами старших курсов при подготовке дипломных и курсовых работ. Все курсовые и дипломные работы, отчёты по педагогической практике и авторефераты хранятся в архиве кафедры. Имеется видеотека с учебными диафильмами и видеофильмами, которые используют преподаватели кафедры при проведении семинарских занятий, на уроках в школе. Восстановлен фонд кинофильмов, с целью его дальнейшего использования на современном оборудовании (DVD-проигрыватели, компьютерная техника). В результате этой долгой работы было записано 14 DVD-дисков, содержащих 99 учебных фильмов.
   На кафедре созданы рабочие места для преподавателей, оснащённые компьютерами. Благоприятная рабочая обстановка всегда присутствует в аудитории - этому способствует множество цветов, фотографии которых можно найти на сайте факультета. В распоряжении сотрудников кафедры имеется 6 компьютеров, 1 цифровая и 1 аналоговая видеокамеры, 4 видеомагнитофона, 2 сканера, ксерокс, а также лазерный, струйный и два матричных принтера. Компьютеры подключены к сети INTERNET.
   Научная деятельность - неотъемлемая часть работы преподавателя. Все практические и теоретические наработки оформляются в виде диссертационных исследований. До 2000 года не было возможности проводить исследования на базе собственной кафедры. И только в 2000 году при кафедре была открыта аспирантура. Первыми её выпускниками успешно защищены диссертации на соискание учёной степени кандидата педагогических наук (Е.Н. Гончарова, С.В. Таныгин, Е.А. Шимко, Л.Е. Андреева).
   Готовятся к защите новые проекты: Е.Б. Карпенко, Н.А. Хомутцова, С.Ю. Александрова, О.Н. Поскотинова, В.А. Бакунькин, О.С. Косихина, О.Г. Мурзинцева.
   Большинство диссертаций нацелены на диссертационные Советы Барнаульского и Новосибирского государственных педагогических университетов. В работе этих Советов принимает участие доктор педагогических наук, профессор кафедры А.А. Шаповалов.
   Кафедра методики преподавания физики имеет многолетние тесные связи: с комитетом по образованию Алтайской краевой администрации; Алтайским краевым институтом повышения квалификации работников образования; отделами образования Индустриального, Железнодорожного районов г. Барнаула; физическим и социологическим факультетами, кафедрой педагогики Алтайского государственного университета; кафедрой методики преподавания физики Челябинского государственного педагогического университета; информационно-методическим центром Омского областного института повышения квалификации работников образования; дорожным центром образования Западно-Сибирского региона (г. Новосибирск); кафедрой психодидактики педагогического университета г. Уфы.
   Под руководством преподавателей кафедры научно-исследовательская работа студентов ведется в направлении создания практически значимых научно-педагогических разработок по всем темам школьного курса физики. Наработанные материалы проходят экспериментальную проверку в школах во время педагогической практики. Оформляются результаты исследовательской работы в виде дипломных проектов. Таких проектов ежегодно защищается от 50 до 80. По материалам научной работы выпускников физического факультета подготовлено пять сборников научных трудов, которые представлены как в электронном виде, так и на бумажном носителе информации. С 2001 г. сборники выставляются на сервере физического факультета в виде кафедрального журнала "Методист".